Bölge, Roma döneminden itibaren yerleşim alanı olarak kullanılmış.
Vadi yamaçlarında yer alan kayaları Romalılar mezarlık, Bizanslılar ise kilise olarak kullanmışlar.
Soğanlı’da kayaya oyulmuş pek çok kilise ve manastır dışında güvercinlik, mağara ve barınaklar da mevcut. Ayrıca ören yerinde bulunan peri bacaları, doğal görünümleri ile Soğanlı Vadisi’ne ayrı bir renk katıyor.
Ören yeri MS 4. yüzyıldan itibaren Hıristiyanlığın Kapadokya’daki merkezlerinden biri olmuş ve önemini 7. ve 8. yüzyıllarda da sürdürmüş.
Tüflerin üzerinde kurulu olan Soğanlı Ören Yeri’nde elliye yakın kaya kilisesi mevcut olup bunlardan sadece sekiz tanesini gezmek mümkün. Diğer yapıların kapıları ve pencereleri geçmiş yıllarda örülerek kapatılmış.